MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli IAI1 chromosome

Total Repeats: 84593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011741	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552586
2	NC_011741	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552586
3	NC_011741	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
4	NC_011741	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	218552587
5	NC_011741	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	218552587
6	NC_011741	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	218552587
7	NC_011741	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
8	NC_011741	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
9	NC_011741	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	218552587
10	NC_011741	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
11	NC_011741	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
12	NC_011741	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
13	NC_011741	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	218552587
14	NC_011741	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
15	NC_011741	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
16	NC_011741	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
17	NC_011741	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
18	NC_011741	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
19	NC_011741	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
20	NC_011741	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	218552587
21	NC_011741	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
22	NC_011741	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	218552587
23	NC_011741	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
24	NC_011741	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
25	NC_011741	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
26	NC_011741	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
27	NC_011741	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	218552587
28	NC_011741	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
29	NC_011741	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
30	NC_011741	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	218552587
31	NC_011741	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552587
32	NC_011741	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
33	NC_011741	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
34	NC_011741	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
35	NC_011741	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
36	NC_011741	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
37	NC_011741	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552587
38	NC_011741	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	218552587
39	NC_011741	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552587
40	NC_011741	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
41	NC_011741	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
42	NC_011741	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	218552587
43	NC_011741	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
44	NC_011741	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
45	NC_011741	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
46	NC_011741	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
47	NC_011741	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
48	NC_011741	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
49	NC_011741	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
50	NC_011741	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
51	NC_011741	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218552587
52	NC_011741	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
53	NC_011741	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552587
54	NC_011741	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	218552587
55	NC_011741	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
56	NC_011741	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
57	NC_011741	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	218552587
58	NC_011741	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552587
59	NC_011741	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
60	NC_011741	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
61	NC_011741	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
62	NC_011741	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552588
63	NC_011741	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	218552588
64	NC_011741	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552588
65	NC_011741	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	218552588
66	NC_011741	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552588
67	NC_011741	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552588
68	NC_011741	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
69	NC_011741	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552588
70	NC_011741	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552588
71	NC_011741	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	218552588
72	NC_011741	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
73	NC_011741	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552588
74	NC_011741	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	218552588
75	NC_011741	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	218552588
76	NC_011741	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	218552588
77	NC_011741	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
78	NC_011741	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	218552588
79	NC_011741	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218552588
80	NC_011741	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
81	NC_011741	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	218552589
82	NC_011741	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	218552589
83	NC_011741	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
84	NC_011741	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
85	NC_011741	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	218552589
86	NC_011741	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
87	NC_011741	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
88	NC_011741	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
89	NC_011741	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552589
90	NC_011741	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	218552589
91	NC_011741	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
92	NC_011741	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
93	NC_011741	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
94	NC_011741	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552589
95	NC_011741	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552589
96	NC_011741	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552589
97	NC_011741	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552589
98	NC_011741	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
99	NC_011741	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	218552589
100	NC_011741	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552589
101	NC_011741	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
102	NC_011741	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
103	NC_011741	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552589
104	NC_011741	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552590
105	NC_011741	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552590
106	NC_011741	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552590
107	NC_011741	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552590
108	NC_011741	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552590
109	NC_011741	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552590
110	NC_011741	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218552590
111	NC_011741	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552590
112	NC_011741	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552590
113	NC_011741	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
114	NC_011741	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218552591
115	NC_011741	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552591
116	NC_011741	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552591
117	NC_011741	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	218552591
118	NC_011741	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552591
119	NC_011741	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552591
120	NC_011741	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552591
121	NC_011741	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552591
122	NC_011741	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552591
123	NC_011741	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
124	NC_011741	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552591
125	NC_011741	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552591
126	NC_011741	AAATCG	2	12	6151	6162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218552591
127	NC_011741	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	218552591
128	NC_011741	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
129	NC_011741	TGG	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552591
130	NC_011741	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552592
131	NC_011741	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
132	NC_011741	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552592
133	NC_011741	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552592
134	NC_011741	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552592
135	NC_011741	GCT	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552592
136	NC_011741	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
137	NC_011741	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
138	NC_011741	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	218552592
139	NC_011741	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552592
140	NC_011741	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552592
141	NC_011741	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	218552592
142	NC_011741	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552592
143	NC_011741	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	218552592
144	NC_011741	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552592
145	NC_011741	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552592
146	NC_011741	A	6	6	7945	7950	100 %	0 %	0 %	0 %	218552592
147	NC_011741	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	218552592
148	NC_011741	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552593
149	NC_011741	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	218552593
150	NC_011741	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	218552593
151	NC_011741	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	218552593
152	NC_011741	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	218552593
153	NC_011741	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
154	NC_011741	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	218552593
155	NC_011741	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
156	NC_011741	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	218552593
157	NC_011741	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
158	NC_011741	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552593
159	NC_011741	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
160	NC_011741	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552593
161	NC_011741	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	218552593
162	NC_011741	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552593
163	NC_011741	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552593
164	NC_011741	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
165	NC_011741	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
166	NC_011741	A	6	6	9165	9170	100 %	0 %	0 %	0 %	218552593
167	NC_011741	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
168	NC_011741	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552594
169	NC_011741	GCG	2	6	9354	9359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552594
170	NC_011741	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552594
171	NC_011741	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552594
172	NC_011741	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	218552594
173	NC_011741	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552594
174	NC_011741	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552594
175	NC_011741	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	218552594
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178	NC_011741	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	218552595
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180	NC_011741	GCG	2	6	10051	10056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552595
181	NC_011741	CAG	2	6	10080	10085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552595
182	NC_011741	GAA	2	6	10149	10154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552595
183	NC_011741	CAG	2	6	10242	10247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552595
184	NC_011741	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	218552595
185	NC_011741	T	6	6	10314	10319	0 %	100 %	0 %	0 %	218552595
186	NC_011741	CAG	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552595
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189	NC_011741	TGG	2	6	10430	10435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552595
190	NC_011741	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	218552596
191	NC_011741	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	218552596
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199	NC_011741	CCA	2	6	11132	11137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552596
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224	NC_011741	A	7	7	12522	12528	100 %	0 %	0 %	0 %	218552598
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232	NC_011741	GTG	2	6	12844	12849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552598
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235	NC_011741	AAG	2	6	12949	12954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552598
236	NC_011741	CAG	2	6	12990	12995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552598
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241	NC_011741	GTG	2	6	13297	13302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552598
242	NC_011741	CTG	3	9	13329	13337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552598
243	NC_011741	TGA	2	6	13381	13386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552598
244	NC_011741	CCAT	2	8	13471	13478	25 %	25 %	0 %	50 %	218552598
245	NC_011741	TGC	2	6	13480	13485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552598
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248	NC_011741	CTT	2	6	13669	13674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552598
249	NC_011741	CTG	2	6	13785	13790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552598
250	NC_011741	GAA	2	6	13812	13817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552598
251	NC_011741	GAC	2	6	13839	13844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552598
252	NC_011741	ACTG	2	8	13865	13872	25 %	25 %	25 %	25 %	218552598
253	NC_011741	CAG	2	6	13968	13973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552598
254	NC_011741	CAG	3	9	13983	13991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552598
255	NC_011741	AAC	2	6	14016	14021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552598
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258	NC_011741	A	6	6	14070	14075	100 %	0 %	0 %	0 %	218552598
259	NC_011741	ATT	2	6	14180	14185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552599
260	NC_011741	ACC	2	6	14261	14266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552599
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262	NC_011741	GGT	2	6	14395	14400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552599
263	NC_011741	GCG	3	9	14405	14413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552599
264	NC_011741	GGC	3	9	14419	14427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552599
265	NC_011741	GGC	2	6	14473	14478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552599
266	NC_011741	GTC	2	6	14486	14491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552599
267	NC_011741	GCG	2	6	14497	14502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552599
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387	NC_011741	T	7	7	21749	21755	0 %	100 %	0 %	0 %	218552606
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